Ežerus panaudoti galima labai įvairiai: rekreacija, žvejyba, hidroenergija, susisiekimas, laukų drėkinimas, vandens tiekimas.
Lietuvos ežerų panaudojimas menkesnis. Dažniausiai jie naudojami rekreacijai ir žvejybai. 17 bendrovių savo veikloje įvardija verslinę žvejybą ežeruose. 84 % Lietuvos ežerų žvejyba per daug intensyvi, juose sumažėjo vertingų rūšių žuvų, todėl nuo 2015 metų ežeruose uždrausta verslinė žvejyba. Labiausiai ežerai naudojami rekreacijai. Tai kaimo turizmo sodybos, stacionarios stovyklavietės, maudyklos, paplūdimiai, valčių prieplaukos. Per ežerus eina baidarių ir kanojų turistiniai maršrutai. Stovyklavimas ežerų pakrantėse turi ir neigiamų pasekmių: įsikuriama ne stovyklavietėse, kūrenami laužai, niokojama gamta ir paliekama ypač daug šiukšlių.