Kamanų gamtinis rezervatas įsteigtas siekiant išsaugoti Kamanų pelkę – didžiausią ir vertingiausią Šiaurės Lietuvoje pelkinį kompleksą su vidaus salomis ir pusiasaliais, klampynių supamomis pelkių akimis bei ežerokšniais ir pelkę supančius miškus, taip pat būdingą retą augaliją, grybiją ir gyvūniją.